Bölüm başkan yardımcısı, eğitim-öğretimin sürdürülmesinde ve bölümün yönetiminde gerekli olan idari işlerin, araştırmaların, akademik ve diğer faaliyetlerin yürütülmesinde bölüm başkanına yardımcı olmak ile sorumludur.

Dr. Öğr. Üyesi Arman Gülnur ve  Dr. Öğr. Üyesi Önder Canbulat, Denizcilik İşletmeleri Yönetimi bölüm başkan yardımcıları olarak görev yapmaktadır.